幌延地圏環境研究所は様々な機関と連携して研究を進め、有用な成果をあげるように努めます。

　幌延地圏環境研究所では、地域特性を生かしつつ、日本原子力研究開発機構が幌延に建設する深地層研究施設を利用した研究の実施が求められており、地元幌延町や幌延深地層研究センター、北海道、経済産業省との連携が必要なことから、これら関係者の参加による幌延地圏環境研究所運営委員会を発足させ、ここで研究所の運営方針など決めています。

　委員会は、上記の関係機関の代表者の他に外部からの学識経験者で構成されています。委員長は幌延町の主体性を考慮し、幌延町長をもってあてることとしています。